2018-06-21から1日間の記事一覧

GNU datamash を使って転置

バイオインフォで扱うデータってcolumnが多い場合が多々あります。 例えば、10X Genomicsの公開データ(bam)をsamtoolsで見てみると。 kimoton@DESKTOP-BL78EM7:~$ samtools view http://s3-us-west-2.amazonaws.com/10x.files/samples/cell-exp/2.1.0/pbmc…